Можно ли забеременеть, если в одном из яичников есть фолликулярная киста

Да, возможно.

Если киста только в одном яичнике – второй может работать полноценно.

Фолликулярная киста – это, по сути, фолликул, который не лопнул. Такое случается. Часто она исчезает сама в следующем цикле. Просто нужно контролировать УЗИ и спокойно к этому подходить.